Perang Cawan Suci: pertempuran sengit antara penyihir di mana tujuh tuan dan pelayan dipanggil mereka berjuang untuk Cawan Suci, sebuah artefak magis yang dapat mengabulkan keinginan apa pun pemenang. Hampir 10 tahun yang lalu, pertempuran terakhir Perang Cawan Suci Keempat mendatangkan malapetaka di Kota Fuyuki dan mengambil lebih dari 500 nyawa, meninggalkan kota itu hancur. Shirou Emiya, yang selamat dari tragedi ini, bercita-cita untuk menjadi pahlawan keadilan seperti penyelamat dan ayah angkatnya, Kiritsugu Emiya. Meskipun hanya seorang siswa, Shirou dilemparkan ke dalam Perang Cawan Suci Kelima ketika dia secara tidak sengaja melihat pertempuran antara pelayan di sekolah dan memanggil pelayannya sendiri, Sabre. Ketika sebuah bayangan misterius memulai pembunuhan yang kejam di Kota Fuyuki, Shirou menyejajarkan dirinya dengan Rin Toosaka, sesama peserta dalam Perang Cawan Suci, untuk menghentikan kematian banyak orang yang tak terhitung jumlahnya. Namun, perasaan Shirou untuk teman dekatnya Sakura Matou membawanya lebih dalam ke rahasia gelap seputar perang dan keluarga yang bertikai terlibat.