Sebuah neraka teknologi yang menyamar sebagai surga, Akademi Tsukimihara adalah sekolah menengah tiruan yang berfungsi sebagai latar untuk Perang Cawan Suci berikutnya. Dibuat oleh komputer Moon Cell, sekolah ini dihuni oleh jiwa-jiwa yang diproyeksikan oleh Bumi yang bahkan memiliki bakat sedikit pun untuk menjadi seorang ‘Guru.’ Dari 256 jiwa ini, 128 akan dipilih untuk turnamen utama dan diberikan Servant. Dengan semua Master yang dipilih, Akademi mengaktifkan pembersihan, menargetkan sisa kehidupan yang tersisa untuk dieliminasi. Bersatu dalam genangan darahnya sendiri, Hakuno Kishinami menolak untuk mati. Dipicu oleh perasaan benci yang tidak diketahui, ia bersumpah untuk berjuang demi keselamatan. Saat dia berjuang untuk melarikan diri dari pengejar yang tanpa henti, dia menemukan pisau merah jatuh ke tanah; dan dengan menariknya keluar, Hakuno memanggil Budaknya sendiri, Sabre, yang langsung menghancurkan pengejarnya dalam kesibukan kelopak mawar. Dengan kekuatan barunya, Hakuno sekarang harus memulai perjalanannya ke inti Moon Cell, Angelica Cage. Di sana, ia akan mengungkap alasan dunia buatan ini dan rahasia masa lalunya yang berlumuran darah.