Setelah sepasang misterius menyerang Rukia Kuchiki dan menghapus ingatannya saat ia berada di Seireitei, Ichigo Kurosaki, seorang pengganti Soul Reaper, secara singkat melupakan Rukia, sampai ia diingatkan oleh Kon, seorang Underpod Mod-Soul. Bingung, ia mencari pemilik toko permen di kotanya, Kisuke Urahara, yang membuka jalur ke Seireitei untuk mereka. Ichigo kemudian terkejut menemukan bahwa sekutunya di Seireitei, Shinigami dari Soul Society, telah melupakannya. Penuh dengan tindakan, Kimi no Na wo Yobu mengikuti Ichigo dan Kon saat mereka melawan mantan rekan mereka saat mencari Rukia yang hilang dan menemukan penyerangnya sebelum menyerang lagi.