Koyomi Araragi, seorang siswa sekolah menengah tahun ketiga, berhasil selamat dari serangan vampir dengan bantuan Meme Oshino, seorang pria aneh yang tinggal di sebuah bangunan yang ditinggalkan. Meskipun diselamatkan dari vampir dan sekarang menjadi manusia lagi, beberapa efek samping seperti kemampuan penyembuhan manusia super dan peningkatan penglihatan masih ada. Apapun, Araragi mencoba untuk menjalani kehidupan seorang siswa normal, dengan bantuan temannya dan ketua kelas, Tsubasa Hanekawa. Ketika teman sekelasnya Hitagi Senjougahara jatuh dari tangga dan ditangkap oleh Araragi, anak laki-laki menyadari bahwa gadis itu tidak wajar tanpa bobot. Meskipun Senjougahara memprotes, Araragi bersikeras dia membantunya, memutuskan untuk meminta bantuan Oshino, orang yang pernah membantunya dengan kesulitannya sendiri. Melalui beberapa kisah yang melibatkan setan dan dewa, Bakemonogatari mengikuti Araragi ketika dia berusaha membantu mereka yang menderita dari penyakit supernatural.