Pada tahun 1972, seorang siswa populer di kelas 3-3 Sekolah Menengah Utara Yomiyama bernama Misaki meninggal dunia selama tahun sekolah. Sejak itu, kota Yomiyama telah diselimuti oleh suasana yang menakutkan, dari rahasia gelap yang tersembunyi jauh di dalam. Dua puluh enam tahun kemudian, Kouichi Sakakibara yang berusia 15 tahun pindah ke kelas 3-3 Yomiyama North dan segera setelah itu menemukan bahwa suasana hati yang aneh dan suram tampaknya menutupi semua siswa. Dia juga mendapati dirinya tertarik pada siswa misterius, yang mengenakan penutup mata, Mei Misaki; Namun, seluruh kelas dan guru-guru tampaknya memperlakukannya seolah dia tidak ada. Tidak mengindahkan peringatan dari semua orang termasuk Mei sendiri, Kouichi mulai semakin dekat tidak hanya dengan dia, tetapi juga dengan kebenaran di balik fenomena mengerikan yang mengganggu kelas 3-3 dari Yomiyama North. Lainnya mengikuti Kouichi, Mei, dan teman sekelas mereka saat mereka ditarik ke dalam teka-teki seputar serangkaian peristiwa tragis yang tak terhindarkan